Saratani ya kongosho ni moja ya tumor mbaya zaidi ulimwenguni na ubashiri mbaya.Kwa hivyo, mfano sahihi wa utabiri unahitajika ili kutambua wagonjwa walio katika hatari kubwa ya saratani ya kongosho ili kurekebisha matibabu na kuboresha ubashiri wa wagonjwa hawa.
Tulipata data ya The Cancer Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) RNAseq kutoka kwa hifadhidata ya UCSC Xena, tukatambua lncRNAs zinazohusiana na kinga (irlncRNAs) kupitia uchanganuzi wa uwiano, na kutambua tofauti kati ya TCGA na tishu za kawaida za kongosho adenocarcinoma.DEirlncRNA) kutoka kwa TCGA na kujieleza kwa tishu za genotype (GTEx) ya tishu za kongosho.Uchambuzi zaidi usiobadilika na wa urejeshaji wa lasso ulifanywa ili kuunda mifano ya saini za ubashiri.Kisha tulihesabu eneo lililo chini ya mkunjo na kuamua thamani bora ya kukatwa kwa ajili ya kutambua wagonjwa walio na adenocarcinoma ya kongosho ya hatari kubwa na ya chini.Ili kulinganisha sifa za kliniki, uingizaji wa seli za kinga, mazingira madogo ya kuzuia kinga, na upinzani wa chemotherapy kwa wagonjwa walio na saratani ya kongosho ya hatari na ya chini.
Tulitambua jozi 20 za DEirlncRNA na kuweka wagonjwa katika vikundi kulingana na thamani bora ya kukatwa.Tulionyesha kuwa mtindo wetu wa saini ya ubashiri una utendaji muhimu katika kutabiri ubashiri wa wagonjwa walio na PAAD.AUC ya curve ya ROC ni 0.905 kwa utabiri wa mwaka 1, 0.942 kwa utabiri wa miaka 2, na 0.966 kwa utabiri wa miaka 3.Wagonjwa walio katika hatari kubwa walikuwa na viwango vya chini vya kuishi na sifa mbaya zaidi za kliniki.Pia tulionyesha kuwa wagonjwa walio katika hatari kubwa hawana kinga na wanaweza kuendeleza upinzani dhidi ya kinga.Tathmini ya dawa za kuzuia saratani kama vile paclitaxel, sorafenib, na erlotinib kulingana na zana za utabiri wa kimahesabu inaweza kuwa mwafaka kwa wagonjwa walio katika hatari kubwa walio na PAAD.
Kwa ujumla, utafiti wetu ulianzisha modeli mpya ya hatari ya ubashiri kulingana na irlncRNA iliyooanishwa, ambayo ilionyesha dhamana ya kuahidi kwa wagonjwa walio na saratani ya kongosho.Kielelezo chetu cha hatari cha ubashiri kinaweza kusaidia kutofautisha wagonjwa walio na PAAD ambao wanafaa kwa matibabu.
Saratani ya kongosho ni tumor mbaya na kiwango cha chini cha kuishi kwa miaka mitano na daraja la juu.Wakati wa uchunguzi, wagonjwa wengi tayari wako katika hatua za juu.Katika muktadha wa janga la COVID-19, madaktari na wauguzi wako chini ya shinikizo kubwa wakati wa kutibu wagonjwa wenye saratani ya kongosho, na familia za wagonjwa pia zinakabiliwa na shinikizo nyingi wakati wa kufanya maamuzi ya matibabu [1, 2].Ingawa maendeleo makubwa yamepatikana katika matibabu ya DOADs, kama vile tiba ya neoadjuvant, upasuaji wa upasuaji, tiba ya mionzi, chemotherapy, tiba inayolengwa ya molekuli, na vizuizi vya ukaguzi wa kinga (ICIs), ni karibu 9% tu ya wagonjwa wanaishi miaka mitano baada ya utambuzi [3. ].], 4].Kwa sababu dalili za awali za adenocarcinoma ya kongosho si za kawaida, wagonjwa kawaida hugunduliwa na metastases katika hatua ya juu [5].Kwa hivyo, kwa mgonjwa fulani, matibabu ya kina ya kibinafsi lazima yapime faida na hasara za chaguzi zote za matibabu, sio tu kuongeza muda wa kuishi, lakini pia kuboresha ubora wa maisha [6].Kwa hivyo, mfano mzuri wa utabiri ni muhimu kutathmini kwa usahihi ubashiri wa mgonjwa [7].Hivyo, matibabu sahihi yanaweza kuchaguliwa ili kusawazisha maisha na ubora wa maisha ya wagonjwa wenye PAAD.
Ubashiri mbaya wa PAAD unatokana hasa na ukinzani wa dawa za kidini.Katika miaka ya hivi karibuni, vizuizi vya ukaguzi wa kinga vimetumika sana katika matibabu ya tumors ngumu [8].Hata hivyo, matumizi ya ICIs katika saratani ya kongosho ni nadra sana kufanikiwa [9].Kwa hiyo, ni muhimu kutambua wagonjwa ambao wanaweza kufaidika na tiba ya ICI.
RNA ndefu isiyo na msimbo (lncRNA) ni aina ya RNA isiyo na misimbo na nakala > nucleotidi 200.LncRNA zimeenea na zinajumuisha takriban 80% ya nakala ya binadamu [10].Idadi kubwa ya kazi imeonyesha kuwa mifano ya ubashiri yenye msingi wa lncRNA inaweza kutabiri kwa ufanisi ubashiri wa mgonjwa [11, 12].Kwa mfano, lncRNAs 18 zinazohusiana na autophagy zilitambuliwa kutoa saini za ubashiri katika saratani ya matiti [13].LncRNA zingine sita zinazohusiana na kinga zimetumika kubaini sifa za ubashiri za glioma [14].
Katika saratani ya kongosho, tafiti zingine zimeanzisha saini za msingi wa lncRNA ili kutabiri ubashiri wa mgonjwa.Saini ya 3-lncRNA ilianzishwa katika adenocarcinoma ya kongosho na eneo chini ya ROC Curve (AUC) ya 0.742 tu na maisha ya jumla (OS) ya miaka 3 [15].Kwa kuongezea, maadili ya usemi wa lncRNA hutofautiana kati ya jenomu tofauti, fomati tofauti za data, na wagonjwa tofauti, na utendakazi wa modeli ya ubashiri sio thabiti.Kwa hivyo, tunatumia algoriti ya kielelezo cha riwaya, kuoanisha na kurudia, ili kuzalisha sahihi za lncRNA (irlncRNA) zinazohusiana na kinga ili kuunda muundo sahihi zaidi na thabiti wa ubashiri [8].
Data ya kawaida ya RNAseq (FPKM) na data ya kliniki ya saratani ya kongosho TCGA na data ya kujieleza kwa tishu za genotype (GTEx) zilipatikana kutoka kwa hifadhidata ya UCSC XENA ( https://xenabrowser.net/datapages/ ).Faili za GTF zilipatikana kutoka kwa hifadhidata ya Ensembl ( http://asia.ensembl.org ) na kutumika kutoa wasifu wa usemi wa lncRNA kutoka kwa RNAseq.Tulipakua jeni zinazohusiana na kinga kutoka kwa hifadhidata ya ImmPort (http://www.immport.org) na kubaini lncRNAs zinazohusiana na kinga (irlncRNAs) kwa kutumia uchanganuzi wa uunganisho (p <0.001, r > 0.4).Utambulisho wa irlncRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti (DEirlncRNAs) kwa kuvuka irlncRNAs na lncRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti zilizopatikana kutoka kwa hifadhidata ya GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) katika kundi la TCGA-PAAD (|logFC| > 1 na FDR <0.05).
Mbinu hii imeripotiwa hapo awali [8].Hasa, tunaunda X ili kuchukua nafasi ya lncRNA A iliyooanishwa na lncRNA B. Wakati thamani ya usemi ya lncRNA A iko juu kuliko thamani ya usemi ya lncRNA B, X inafafanuliwa kama 1, vinginevyo X inafafanuliwa kama 0. Kwa hivyo, tunaweza kupata matrix ya 0 au - 1. Mhimili wima wa matriki unawakilisha kila sampuli, na mhimili mlalo unawakilisha kila jozi ya DEirlncRNA yenye thamani ya 0 au 1.
Uchanganuzi usio tofauti wa urejeshi unaofuatwa na urejeleaji wa Lasso ulitumika kukagua jozi za ubashiri za DEirlncRNA.Uchanganuzi wa urejeleaji wa lasso ulitumia uthibitishaji wa mara 10 unaorudiwa mara 1000 ( p <0.05), na vichocheo 1000 bila mpangilio kwa kila kukimbia.Wakati marudio ya kila jozi ya DEirlncRNA yalipozidi mara 100 katika mizunguko 1000, jozi za DEirlncRNA zilichaguliwa ili kuunda modeli ya hatari ya ubashiri.Kisha tulitumia curve ya AUC kupata thamani kamili ya kukatwa kwa kuainisha wagonjwa wa PAAD katika vikundi vya hatari ya juu na ya chini.Thamani ya AUC ya kila modeli pia ilikokotolewa na kupangwa kama curve.Ikiwa curve itafikia hatua ya juu zaidi inayoonyesha thamani ya juu ya AUC, mchakato wa kuhesabu huacha na mtindo unachukuliwa kuwa mgombea bora.Mifano ya 1-, 3- na 5 ya miaka ya ROC ya curve ilijengwa.Michanganuo isiyo ya kawaida na ya aina nyingi ya urejeshaji ilitumiwa kuchunguza utendaji huru wa ubashiri wa mfano wa hatari ya ubashiri.
Tumia zana saba kusoma viwango vya kupenya kwa seli za kinga, ikijumuisha XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS na CIBERSORT.Data ya kupenya kwa seli za kinga ilipakuliwa kutoka hifadhidata ya TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Tofauti katika maudhui ya seli zinazopenya kinga kati ya makundi ya hatari ya juu na ya chini ya muundo uliojengwa ilichambuliwa kwa kutumia mtihani wa kiwango cha saini cha Wilcoxon, matokeo yanaonyeshwa kwenye grafu ya mraba.Uchanganuzi wa uunganisho wa Spearman ulifanywa ili kuchanganua uhusiano kati ya maadili ya alama za hatari na seli zinazopenya kinga.Mgawo wa uunganisho unaotokana unaonyeshwa kama lollipop.Kiwango cha umuhimu kiliwekwa kwa p <0.05.Utaratibu ulifanywa kwa kutumia kifurushi cha R ggplot2.Ili kuchunguza uhusiano kati ya modeli na viwango vya usemi wa jeni vinavyohusishwa na kasi ya kupenya kwa seli za kinga, tulitekeleza kifurushi cha ggstatsplot na taswira ya njama ya violin.
Ili kutathmini mifumo ya matibabu ya saratani ya kongosho, tulikokotoa IC50 ya dawa za kidini zinazotumiwa sana katika kundi la TCGA-PAAD.Tofauti katika viwango vya nusu vizuizi (IC50) kati ya vikundi vya hatari kubwa na vya chini vililinganishwa kwa kutumia jaribio la kiwango cha saini cha Wilcoxon, na matokeo yanaonyeshwa kama sehemu za sanduku zinazozalishwa kwa kutumia pRrophetic na ggplot2 katika R. Mbinu zote zinatii miongozo na kanuni zinazofaa.
Mtiririko wa kazi ya utafiti wetu umeonyeshwa kwenye Mchoro 1. Kwa kutumia uchanganuzi wa uwiano kati ya lncRNA na jeni zinazohusiana na kinga, tulichagua 724 irlncRNAs na p <0.01 na r > 0.4.Kisha tukachanganua lncRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti za GEPIA2 (Mchoro 2A).Jumla ya irlncRNA 223 zilionyeshwa kwa njia tofauti kati ya adenocarcinoma ya kongosho na tishu za kawaida za kongosho (|logFC| > 1, FDR <0.05), zilizopewa jina DEirlncRNAs.
Ujenzi wa mifano ya hatari inayotabirika.(A) Mpango wa Volcano wa lncRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti.(B) Usambazaji wa vigawo vya lasso kwa jozi 20 za DEirlncRNA.(C) Tofauti ya uwezekano wa mgawo wa mgawo wa LASSO.(D) Kiwanja cha msitu kinachoonyesha uchanganuzi wa urejeshi usiobadilika wa jozi 20 za DEirlncRNA.
Kisha tukaunda matrix 0 au 1 kwa kuoanisha 223 DEirlncRNAs.Jumla ya jozi 13,687 za DEirlncRNA zilitambuliwa.Baada ya uchanganuzi wa urejeleaji usiobadilika na wa lasso, jozi 20 za DEirlncRNA hatimaye zilijaribiwa ili kuunda modeli ya hatari ya ubashiri (Mchoro 2B-D).Kulingana na matokeo ya Lasso na uchanganuzi mwingi wa rejeshi, tulikokotoa alama ya hatari kwa kila mgonjwa katika kundi la TCGA-PAAD (Jedwali 1).Kulingana na matokeo ya uchanganuzi wa urekebishaji wa lasso, tulikokotoa alama ya hatari kwa kila mgonjwa katika kundi la TCGA-PAAD.AUC ya curve ya ROC ilikuwa 0.905 kwa utabiri wa mfano wa hatari wa mwaka 1, 0.942 kwa utabiri wa miaka 2, na 0.966 kwa utabiri wa miaka 3 (Mchoro 3A-B).Tuliweka thamani kamili ya 3.105, tukaweka kundi la wagonjwa wa TCGA-PAAD katika vikundi vilivyo katika hatari kubwa na ya chini, na kupanga matokeo ya kuishi na ugawaji wa alama za hatari kwa kila mgonjwa (Mchoro 3C-E).Uchunguzi wa Kaplan-Meier ulionyesha kuwa maisha ya wagonjwa wa PAAD katika kundi la hatari ilikuwa chini sana kuliko ya wagonjwa katika kundi la hatari ndogo (p <0.001) (Mchoro 3F).
Uhalali wa mifano ya hatari ya ubashiri.(A) ROC ya modeli ya hatari ya ubashiri.(B) 1-, 2-, na 3-mwaka mifano ya hatari ya ubashiri ROC.(C) ROC ya mfano wa hatari ya ubashiri.Inaonyesha sehemu mojawapo ya kukatwa.(DE) Usambazaji wa hali ya kuishi (D) na alama za hatari (E).(F) Uchambuzi wa Kaplan-Meier wa wagonjwa wa PAAD katika vikundi vya hatari na vya chini.
Tulikagua zaidi tofauti za alama za hatari kulingana na sifa za kiafya.Mchoro wa mstari (Mchoro 4A) unaonyesha uhusiano wa jumla kati ya sifa za kiafya na alama za hatari.Hasa, wagonjwa wakubwa walikuwa na alama za hatari zaidi (Kielelezo 4B).Kwa kuongezea, wagonjwa walio na hatua ya II walikuwa na alama za hatari zaidi kuliko wagonjwa walio na hatua ya I (Mchoro 4C).Kuhusu daraja la uvimbe kwa wagonjwa wa PAAD, wagonjwa wa daraja la 3 walikuwa na alama za hatari zaidi kuliko wagonjwa wa daraja la 1 na 2 (Kielelezo 4D).Tulifanya zaidi uchanganuzi wa urejeshi usiobadilika na wa aina nyingi na tukaonyesha kuwa alama za hatari (p <0.001) na umri (p = 0.045) zilikuwa sababu za ubashiri huru kwa wagonjwa walio na PAAD (Mchoro 5A-B).Curve ya ROC ilionyesha kuwa alama ya hatari ilikuwa bora kuliko sifa nyingine za kliniki katika kutabiri 1-, 2-, na maisha ya miaka 3 ya wagonjwa wenye PAAD (Mchoro 5C-E).
Tabia za kliniki za mifano ya hatari ya ubashiri.Histogramu (A) inaonyesha (B) umri, (C) hatua ya uvimbe, (D) daraja la uvimbe, alama ya hatari, na jinsia ya wagonjwa katika kundi la TCGA-PAAD.**p <0.01
Uchambuzi huru wa utabiri wa mifano ya hatari ya ubashiri.(AB) Univariate (A) na multivariate (B) uchanganuzi wa regression wa mifano ya hatari ya ubashiri na sifa za kiafya.(CE) 1-, 2-, na 3-year ROC kwa mifano ya hatari ya ubashiri na sifa za kiafya
Kwa hiyo, tulichunguza uhusiano kati ya muda na alama za hatari.Tuligundua kuwa alama za hatari kwa wagonjwa wa PAAD zilihusishwa kinyume na seli za CD8+ T na seli za NK (Kielelezo 6A), ikionyesha utendaji wa kinga uliokandamizwa katika kundi lililo katika hatari kubwa.Pia tulitathmini tofauti katika uingizaji wa seli za kinga kati ya makundi ya juu na ya chini na tukapata matokeo sawa (Mchoro 7).Kulikuwa na upenyezaji mdogo wa seli za CD8+ T na seli za NK katika kundi lililo katika hatari kubwa.Katika miaka ya hivi karibuni, vizuizi vya ukaguzi wa kinga (ICIs) vimetumika sana katika matibabu ya tumors ngumu.Walakini, matumizi ya ICIs katika saratani ya kongosho haijafanikiwa mara chache.Kwa hivyo, tulitathmini usemi wa jeni za ukaguzi wa kinga katika vikundi vya hatari kubwa na vya chini.Tuligundua kwamba CTLA-4 na CD161 (KLRB1) walikuwa overexpressed katika kundi la hatari ya chini (Kielelezo 6B-G), kuonyesha kwamba wagonjwa PAAD katika kundi la hatari inaweza kuwa nyeti kwa ICI.
Uchambuzi wa uhusiano wa mfano wa hatari ya ubashiri na uingizaji wa seli za kinga.(A) Uwiano kati ya modeli ya hatari ya ubashiri na uingizaji wa seli za kinga.(BG) Huonyesha usemi wa jeni katika makundi yenye hatari kubwa na ya chini.(HK) Thamani za IC50 kwa dawa maalum za kuzuia saratani katika vikundi vya hatari kubwa na ya chini.*p <0.05, **p <0.01, ns = sio muhimu
Tulikagua zaidi uhusiano kati ya alama za hatari na mawakala wa kawaida wa tibakemikali katika kundi la TCGA-PAAD.Tulitafuta dawa za kuzuia saratani zinazotumika sana katika saratani ya kongosho na tukachanganua tofauti katika maadili yao ya IC50 kati ya vikundi vilivyo katika hatari kubwa na ya chini.Matokeo yalionyesha kuwa thamani ya IC50 ya AZD.2281 (olaparib) ilikuwa ya juu zaidi katika kundi la hatari, ikionyesha kuwa wagonjwa wa PAAD katika kundi la hatari wanaweza kuwa sugu kwa matibabu ya AZD.2281 (Mchoro 6H).Kwa kuongezea, maadili ya IC50 ya paclitaxel, sorafenib, na erlotinib yalikuwa chini katika kundi la hatari kubwa (Mchoro 6I-K).Pia tulitambua dawa 34 za kuzuia saratani zenye viwango vya juu vya IC50 katika kundi lililo hatarini zaidi na dawa 34 za kuzuia saratani zenye viwango vya chini vya IC50 katika kundi lililo katika hatari kubwa (Jedwali la 2).
Haiwezi kukataliwa kuwa lncRNAs, mRNAs, na miRNAs zipo sana na huchukua jukumu muhimu katika ukuzaji wa saratani.Kuna ushahidi wa kutosha unaounga mkono jukumu muhimu la mRNA au miRNA katika kutabiri maisha ya jumla katika aina kadhaa za saratani.Bila shaka, mifano mingi ya hatari ya ubashiri pia inategemea lncRNAs.Kwa mfano, Luo et al.Uchunguzi umeonyesha kuwa LINC01094 ina jukumu muhimu katika kuenea kwa PC na metastasis, na usemi wa juu wa LINC01094 unaonyesha maisha duni ya wagonjwa wa saratani ya kongosho [16].Utafiti uliowasilishwa na Lin et al.Uchunguzi umeonyesha kuwa kupunguzwa kwa lncRNA FLVCR1-AS1 kunahusishwa na ubashiri mbaya kwa wagonjwa wa saratani ya kongosho [17].Walakini, lncRNA zinazohusiana na kinga hazijadiliwi kidogo katika suala la kutabiri maisha ya jumla ya wagonjwa wa saratani.Hivi majuzi, kiasi kikubwa cha kazi kimelenga kujenga mifano ya hatari ya ubashiri ili kutabiri maisha ya wagonjwa wa saratani na kwa hivyo kurekebisha mbinu za matibabu [18, 19, 20].Kuna ongezeko la utambuzi wa jukumu muhimu la upenyezaji wa kinga katika uanzishaji wa saratani, maendeleo, na mwitikio wa matibabu kama vile chemotherapy.Tafiti nyingi zimethibitisha kuwa seli za kinga zinazoingia kwenye tumor zina jukumu muhimu katika kukabiliana na chemotherapy ya cytotoxic [21, 22, 23].Mazingira ya kinga ya tumor ni jambo muhimu katika maisha ya wagonjwa wa tumor [24, 25].Tiba ya kinga mwilini, haswa tiba ya ICI, hutumiwa sana katika matibabu ya uvimbe dhabiti [26].Jeni zinazohusiana na kinga hutumiwa sana kuunda mifano ya hatari ya ubashiri.Kwa mfano, Su et al.Mtindo wa hatari ya ubashiri unaohusiana na kinga unategemea jeni za kuweka alama za protini ili kutabiri ubashiri wa wagonjwa wa saratani ya ovari [27].Jeni zisizo na misimbo kama vile lncRNAs pia zinafaa kwa kuunda mifano ya hatari ya ubashiri [28, 29, 30].Luo et al alijaribu lncRNA nne zinazohusiana na kinga na kujenga mfano wa kutabiri hatari ya saratani ya shingo ya kizazi [31].Khan et al.Jumla ya nakala 32 zilizoonyeshwa kwa njia tofauti zilitambuliwa, na kwa msingi wa hii, mfano wa utabiri na nakala 5 muhimu ulianzishwa, ambayo ilipendekezwa kama zana iliyopendekezwa sana ya kutabiri kukataliwa kwa papo hapo kwa biopsy baada ya kupandikizwa kwa figo [32].
Nyingi ya miundo hii inategemea viwango vya usemi wa jeni, ama jeni za usimbaji wa protini au jeni zisizo za kusimba.Walakini, jeni moja linaweza kuwa na maadili tofauti ya kujieleza katika jenomu tofauti, fomati za data na kwa wagonjwa tofauti, na kusababisha makadirio yasiyokuwa thabiti katika mifano ya ubashiri.Katika utafiti huu, tulijenga muundo unaofaa na jozi mbili za lncRNAs, zisizotegemea maadili kamili ya kujieleza.
Katika utafiti huu, tulitambua irlncRNA kwa mara ya kwanza kupitia uchanganuzi wa uwiano na jeni zinazohusiana na kinga.Tulikagua 223 DEirlncRNAs kwa kuchanganywa na lncRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti.Pili, tuliunda matrix 0-au-1 kulingana na mbinu iliyochapishwa ya kuoanisha ya DEirlncRNA [31].Kisha tulifanya uchanganuzi wa urejeleaji usiobadilika na wa lasso ili kutambua jozi za ubashiri za DEirlncRNA na kuunda muundo wa hatari unaotabirika.Tulichambua zaidi uhusiano kati ya alama za hatari na sifa za kliniki kwa wagonjwa walio na PAAD.Tuligundua kuwa modeli yetu ya hatari ya ubashiri, kama sababu huru ya ubashiri kwa wagonjwa wa PAAD, inaweza kutofautisha ipasavyo wagonjwa wa daraja la juu kutoka kwa wagonjwa wa daraja la chini na wagonjwa wa daraja la juu kutoka kwa wagonjwa wa daraja la chini.Kwa kuongezea, maadili ya AUC ya curve ya ROC ya modeli ya hatari ya ubashiri yalikuwa 0.905 kwa utabiri wa mwaka 1, 0.942 kwa utabiri wa miaka 2, na 0.966 kwa utabiri wa miaka 3.
Watafiti waliripoti kuwa wagonjwa walio na uingizaji wa juu wa seli za CD8+ T walikuwa nyeti zaidi kwa matibabu ya ICI [33].Kuongezeka kwa maudhui ya seli za cytotoxic, seli za CD56 NK, seli za NK na seli za CD8+ T katika mazingira madogo ya kinga ya uvimbe inaweza kuwa mojawapo ya sababu za athari ya kukandamiza uvimbe [34].Uchunguzi wa awali ulionyesha kuwa viwango vya juu vya CD4(+) T na CD8(+) T ya kupenyeza ya juu vilihusishwa kwa kiasi kikubwa na kuishi kwa muda mrefu [35].Upenyezaji hafifu wa seli za CD8 T, mzigo mdogo wa neoantijeni, na mazingira madogo ya uvimbe yanayopunguza kinga husababisha kukosekana kwa majibu kwa tiba ya ICI [36].Tuligundua kuwa alama za hatari zilihusiana vibaya na seli za CD8+ T na seli za NK, ikionyesha kuwa wagonjwa walio na alama za hatari zaidi wanaweza wasifai kwa matibabu ya ICI na kuwa na ubashiri mbaya zaidi.
CD161 ni alama ya seli za muuaji asilia (NK).Seli za CD8+CD161+ CAR-zilizohamishwa hupatanisha utendakazi wa vivo antitumor katika modeli za HER2+ za kongosho za adenocarcinoma xenograft [37].Vizuizi vya ukaguzi wa kinga hulenga njia za lymphocyte ya cytotoxic T inayohusishwa na protini 4 (CTLA-4) na protini ya kifo cha seli iliyoratibiwa 1 (PD-1)/iliyopangwa ya seli ya kifo cha ligand 1 (PD-L1) na ina uwezo mkubwa katika maeneo mengi.Usemi wa CTLA-4 na CD161 (KLRB1) ni wa chini katika vikundi vilivyo katika hatari kubwa, ikionyesha zaidi kuwa wagonjwa walio na alama za hatari wanaweza wasistahiki matibabu ya ICI.[38]
Ili kupata njia za matibabu zinazofaa kwa wagonjwa walio katika hatari kubwa, tulichanganua dawa mbalimbali za kuzuia saratani na tukagundua kuwa paclitaxel, sorafenib na erlotinib, ambazo hutumiwa sana kwa wagonjwa walio na PAAD, zinaweza kuwafaa wagonjwa walio katika hatari kubwa ya PAAD.[33].Zhang et al aligundua kuwa mabadiliko katika njia yoyote ya uharibifu wa DNA (DDR) inaweza kusababisha ubashiri mbaya kwa wagonjwa wa saratani ya prostate [39].Jaribio la Kansa ya Kongosho ya Olaparib Inayoendelea (POLO) ilionyesha kuwa matibabu ya matengenezo na olaparib ya kuishi bila kuendelea kwa muda mrefu ikilinganishwa na placebo baada ya chemotherapy ya msingi ya platinamu kwa wagonjwa walio na adenocarcinoma ya ductal ya kongosho na mabadiliko ya germline BRCA1/2 [40].Hii inatoa matumaini makubwa kwamba matokeo ya matibabu yataboresha kwa kiasi kikubwa katika kikundi hiki cha wagonjwa.Katika utafiti huu, thamani ya IC50 ya AZD.2281 (olaparib) ilikuwa ya juu zaidi katika kundi la hatari, ikionyesha kwamba wagonjwa wa PAAD katika kundi la hatari wanaweza kuwa sugu kwa matibabu na AZD.2281.
Mifano ya utabiri katika utafiti huu hutoa matokeo mazuri ya utabiri, lakini ni msingi wa utabiri wa uchambuzi.Jinsi ya kuthibitisha matokeo haya na data ya kliniki ni swali muhimu.Endoscopic faini aspiration sindano ultrasonografia (EUS-FNA) imekuwa njia ya lazima ya kugundua vidonda vya kongosho vilivyo na unyeti wa 85% na umaalum wa 98% [41].Ujio wa sindano za EUS-needle biopsy (EUS-FNB) hutegemea hasa manufaa yanayofikiriwa juu ya FNA, kama vile usahihi wa juu wa uchunguzi, kupata sampuli zinazohifadhi muundo wa histolojia, na hivyo kuzalisha tishu za kinga ambazo ni muhimu kwa uchunguzi fulani .madoa maalum [42].Ukaguzi wa utaratibu wa fasihi ulithibitisha kuwa sindano za FNB (hasa 22G) zinaonyesha ufanisi wa juu zaidi katika kuvuna tishu kutoka kwa wingi wa kongosho [43].Kliniki, ni idadi ndogo tu ya wagonjwa wanaostahili upasuaji mkali, na wagonjwa wengi wana uvimbe usioweza kufanya kazi wakati wa uchunguzi wa awali.Katika mazoezi ya kliniki, ni sehemu ndogo tu ya wagonjwa wanaofaa kwa upasuaji mkali kwa sababu wagonjwa wengi wana uvimbe usioweza kufanya kazi wakati wa uchunguzi wa awali.Baada ya uthibitisho wa kiafya na EUS-FNB na mbinu zingine, matibabu sanifu yasiyo ya upasuaji kama vile chemotherapy kawaida huchaguliwa.Mpango wetu wa utafiti unaofuata ni kujaribu muundo wa ubashiri wa utafiti huu katika vikundi vya upasuaji na visivyo vya upasuaji kupitia uchanganuzi wa kutazama nyuma.
Kwa ujumla, utafiti wetu ulianzisha modeli mpya ya hatari ya ubashiri kulingana na irlncRNA iliyooanishwa, ambayo ilionyesha dhamana ya kuahidi kwa wagonjwa walio na saratani ya kongosho.Kielelezo chetu cha hatari cha ubashiri kinaweza kusaidia kutofautisha wagonjwa walio na PAAD ambao wanafaa kwa matibabu.
Seti za data zilizotumiwa na kuchambuliwa katika utafiti wa sasa zinapatikana kutoka kwa mwandishi sambamba kwa ombi linalofaa.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Jukumu la upatanishi la ufanisi wa kibinafsi katika udhibiti wa kihisia wa hisia hasi wakati wa janga la COVID-19: utafiti wa sehemu mbalimbali.Int J Ment Health Nurs [makala ya jarida].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al.Maoni ya wanafamilia kuhusu kufanya maamuzi mbadala katika vitengo vya wagonjwa mahututi: mapitio ya utaratibu.INT J NURS STUD [makala ya gazeti;hakiki].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Kansa ya Pancreatic.Lancet.[Makala ya gazeti;msaada wa utafiti, NIH, extramural;msaada wa utafiti, serikali nje ya Marekani;hakiki].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemiolojia ya saratani ya kongosho.Jarida la Dunia la Gastroenterology.[Makala ya jarida, hakiki].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogram mpya inayohusiana na tp53 ya kutabiri maisha ya jumla ya wagonjwa walio na saratani ya kongosho.Saratani ya BMC [makala ya jarida].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Athari ya tiba inayolenga suluhisho kwa uchovu unaohusiana na saratani kwa wagonjwa wa saratani ya utumbo mpana wanaopokea tiba ya kemikali: jaribio lililodhibitiwa bila mpangilio.Muuguzi wa saratani.[Makala ya gazeti;jaribio la kudhibitiwa nasibu;utafiti unaungwa mkono na serikali nje ya Marekani].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al.Viwango vya antijeni ya saratani ya baada ya upasuaji (CEA) hutabiri matokeo baada ya kuondolewa kwa saratani ya colorectal kwa wagonjwa walio na viwango vya kawaida vya CEA kabla ya upasuaji.Kituo cha Utafiti wa Saratani ya Tafsiri.[Makala ya gazeti].2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.LncRNAs zinazohusiana na kinga huzalisha saini za riwaya na kutabiri mazingira ya kinga ya saratani ya hepatocellular ya binadamu.Mol Ther Nucleic acids [Makala ya jarida].2020 2020-12-04;22:937 - 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunotherapy kwa saratani ya kongosho: vikwazo na mafanikio.Ann Daktari wa Upasuaji wa Utumbo [Kifungu cha Jarida;hakiki].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNA za muda mrefu zisizo na misimbo (LncRNAs), genomics ya tumor ya virusi na matukio ya kuunganisha yasiyo ya kawaida: athari za matibabu.AM J CANCER RES [makala ya jarida;hakiki].2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Utambuaji wa saini za lncRNA zinazohusiana na ubashiri wa saratani ya endometriamu.Mafanikio ya sayansi [makala ya gazeti].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Uchanganuzi wa kina wa jeni za ubashiri zinazofunga RNA na watahiniwa wa dawa katika saratani ya seli ya figo ya papilari.pregen.[Makala ya gazeti].2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al.Sifa za RNA inayohusiana na autophagy kwa muda mrefu isiyo na misimbo inatabiri ubashiri wa saratani ya matiti.pregen.[Makala ya gazeti].2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Sahihi sita za lncRNA zinazohusiana na kinga huboresha ubashiri katika glioblastoma multiforme.MOL Neurobiolojia.[Makala ya gazeti].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.Saini ya riwaya ya tri-lncRNA inatabiri kuishi kwa wagonjwa walio na saratani ya kongosho.WAWAKILISHI WA ONKOL.[Makala ya gazeti].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 inakuza maendeleo ya saratani ya kongosho kwa kudhibiti kujieleza kwa LIN28B na njia ya PI3K/AKT kupitia miR-577 yenye sponji.Tiba ya Mol - Asidi za Nucleic.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Maoni chanya kati ya lncRNA FLVCR1-AS1 na KLF10 yanaweza kuzuia kuendelea kwa saratani ya kongosho kupitia njia ya PTEN/AKT.J EXP Clin Cancer Res.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Utambulisho wa jeni kumi na tatu unaotabiri maisha ya jumla katika saratani ya hepatocellular.Mwakilishi wa Biosci [makala ya jarida].2021 04/09/2021.
Muda wa kutuma: Sep-22-2023